加拿大奶业网(CDN)的基本原则和任务,是尽可能地为加拿大的乳用品种牛,提供最准确的育种值估计结果。可是,在采用基因组检测估计育种值的方法问世后的这5年多时间里,CDN的这一目标遭遇到极大的挑战。CDN的遗传学家们一直在努力工作,以寻找用于计算传统的遗传(后测)估计和基因组检测估计育种值的改进方法。这些研究结果经与业内专家进行交流后形成的各种估计改进方法,都将在2015年4月进行遗传基础的年度更新时,一并予以贯彻执行。换句话说,将于加拿大当地时间2015年4月7日正式发布的奶牛育种值估计结果,已经包含了由CDN主导的多方面的改进内容。这些改进表明,育种值估计确实更加准确了,但同时也导致这种一次性的调整极其明显;所带来的综合影响虽因性状不同而有所差异,但对基因组检测(尤其是所谓排名前100名的精英级的)小公牛、小母牛们来说,影响尤为显著。这是育种者和相关公司/组织必须引起高度重视的,应该根据在极端水平上业已收窄的基因组检测估计结果,对其选种标准和选择决策,进行相应的调整。
下表给出的是CDN所作的这些变化对北美基因组检测小公牛以及GPA LPI排名前100名的小公牛的平均影响。对绝大多数性状来说,就基因组检测小公牛而言,影响相对较小,尽管生产性性状和主要体型性状以及生产寿命性状,总体来看都是降低的,转化成LPI,平均约回落了65点。当然,虽然平均变化更为重要,但对高排名的基因组检测小公牛(如表所示),其GPA LPI却平均下降了129点,降低最大的性状除了体型、生产寿命、体型外貌中的主要性状外,还有乳脂量性状(体型下降3.3点,生产寿命下降2.6点,乳脂量下降7.5 kg)。基因组检测小母牛的情况类似。因此,育种者将不得不在拟订育种计划时,调整他们估计、选择精英级基因组检测小公牛、小母牛的标准。
性状 |
所有基因组检测小公牛 |
GPA LPI排名前100小公牛 |
LPI |
-65 |
-129 |
奶产量 |
-33 |
-82 |
乳脂量 |
-2.0 |
-4.8 |
乳蛋白量 |
-1.1 |
-2.4 |
体型外貌 |
-1.1 |
-2.4 |
泌乳系统 |
-0.7 |
-1.4 |
肢蹄 |
-0.6 |
-1.3 |
乳用强度 |
-0.5 |
-1.4 |
尻部 |
-0.3 |
-0.7 |
生产寿命 |
-1.2 |
-2.0 |
体细胞分 |
0.02 |
0.02 |
乳房炎抵抗力 |
-0.1 |
-0.1 |
女儿繁殖力 |
-0.4 |
-0.5 |
泌乳速度 |
0.0 |
0.4 |
泌乳性情 |
-0.1 |
0.6 |
产犊能力 |
-0.2 |
-0.3 |
女儿产犊能力 |
-0.3 |
-0.5 |
何况评分 |
-0.2 |
-0.4 |
表 2015年4月改进后对基因组检测育种值估计的影响
对比改变前后的结果发现,GPA LPI达3000以上的,其平均降幅约为3%;2500~3000之间者为2%。目前,基因组检测小公牛GPA LPI达到3000以上的,99%都有所下降,极端个案甚至下降高达250点。
另外,体型是此次调整受影响最大的性状。采用新的计算方法后,体型值,与后测公牛相比,此前被高估的基因组检测小公牛都得到降低。基因组检测小母牛也一样。对GPA LPI排名前100的,下降2.4,极端个案可下降达4甚至4点以上。此外,由此次遗传基础更新所引起的体型值下调,对所有牛都有份,约1个点。